在金融危机冲击下，全球都笼罩在经济萧条的阴影下，而昆山很多企业却表现出较强的抗风险能力。这得益于不断提高自主创新能力，为区域经济发展“强筋健骨”。相比其他企业，高新技术企业往往凭借其技术创新优势、人才优势和品牌优势，在市场竞争中占据有利地位，同时抗风险能力也相对较强。

　　仔细研究昆山这些在危机中起飞的企业便不难发现，它们有一个共同的特点：通过自主创新，拥有核心自主知识产权。高新技术产业的发展是保证昆山市经济活力和可持续发展的根本，而自主创新型企业，则能够增强地区经济实力和科技竞争力。昆山市大量自主创新型企业的茁壮成长正是昆山经济发展能够保持稳定的重要因素。

　　通过设立创业投资基金和建立公共技术平台等措施，形成一批具有国际竞争力的制造企业，推动“昆山制造”向“昆山智造”转变。昆山高新区则是昆山市迈向“昆山智造”的创新之源

　　2008年10月30日，我国首个以核酸制药为主的生物技术特色产业基地——小核酸产业基地在昆山高新区正式奠基，昆山市工研院小核酸生物技术研究所同时揭牌。这两个载体将吸引小核酸相关技术及我国领先的科研和开发力量、产业资本集聚昆山，打造中国小核酸制药“硅谷”，在小核酸制药领域形成产业优势，造福人类。
　　小核酸产业基地是昆山市、昆山市工研院、清华科技园昆山分园共建的特色产业基地，由孵化器和入园企业集聚区组成。该基地将建设五大技术支撑体系，即实验中心、中试基地、实验动物中心、环保体系和安全生产体系，另外还包括金融服务和专业服务体系。小核酸生物技术研究所是该基地的公共研发及中试平台，设有10个研究室，目前已经开展小核酸大规模液相合成、抗乙肝小核酸药物等项目研究。
　　小核酸技术是生命科学研究领域的重大突破，该项技术的研究与应用，必将在全球生物医药行业形成一个具有极大价值链的产业集群，具有广阔的发展前景。正是由于看好这一先导产业的发展前景，在昆山高新区的规划里，小核酸产业被看作支撑昆山长线发展的未来产业，在未来10－15年里将会真正爆发。
　　目前，昆山高新区在太阳能领域，园区引进了世界第五大太阳能电池生产商茂迪公司；在机器人领域，引进了我国台湾高晟机器人项目。昆山高新区全力打造的可再生能源产业基地、模具产业基地、小核酸产业基地、机器人产业基地四大特色产业基地正在加紧形成中。